کتاب خانه افرا داستان زندگی ادوار اِیوان، مأمور اطلاعات سابق است که تجربیات دلخراشی در جنگ‌های بوسنی داشته. همسر او، دبورا که تحلیل‌گر روابط خاورمیانه در سرویس اطلاعاتی بریتانیا بوده، سرطان دارد. آنها در آنگلیای شرقی در خانه‌ای زندگی می‌کنند که نام آن را سیلورویو گذاشته‌اند. در این میان شخصیتی دیگر به نام استوارت پراکتور وارد داستان می‌شود که زمانی رئیس امنیت داخلی بوده؛ اما بعد از یک واقعه مرموز، بازنشسته می‌شود. آیا او در گذشته با ادوارد رابطه‌ای داشته؟...